描述:eDNA魚(yú)類(lèi)種群采樣調(diào)查系統(tǒng)環(huán)境 DNA(environmental DNA, eDNA)是指可以從環(huán)境樣品(如水、土壤、空氣、冰芯等)中直接提取到的DNA 片段總和。eDNA 技術(shù)是近年來(lái)新出現(xiàn)的一種生物調(diào)查方法技術(shù),
品牌 | 其他品牌 | 產(chǎn)地類(lèi)別 | 國(guó)產(chǎn) |
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應(yīng)用領(lǐng)域 | 環(huán)保,生物產(chǎn)業(yè),農(nóng)業(yè) |
水環(huán)境eDNA解決方案
——水環(huán)境eDNA便攜采集系統(tǒng)-生物調(diào)查物種入侵調(diào)查
前言:
eDNA魚(yú)類(lèi)種群采樣調(diào)查系統(tǒng)環(huán)境 DNA(environmental DNA, eDNA)是指可以從環(huán)境樣品(如水、土壤、空氣、冰芯等)中直接提取到的DNA 片段總和。eDNA 技術(shù)是近年來(lái)新出現(xiàn)的一種生物調(diào)查方法技術(shù),由 包括eDNA 獲取、基因分析和結(jié)果分析 3 個(gè)部分組成。與傳統(tǒng)方法相比,eDNA 技術(shù)具有靈敏度高, 省時(shí)省力, 對(duì)調(diào)查對(duì)象無(wú)損傷等優(yōu)點(diǎn),而且不要求調(diào)查人員具有傳統(tǒng)的生物識(shí)別及鑒定經(jīng)驗(yàn)。目前eDNA 技術(shù)已被應(yīng)用于目標(biāo)物種(如入侵物種、瀕危物種及其他稀有物種)"有無(wú)"的檢測(cè), 生物量的估測(cè),在水生生態(tài)系統(tǒng)的保護(hù)中具有廣泛的應(yīng)用前景。
應(yīng)用領(lǐng)域:魚(yú)類(lèi)資源調(diào)查、微生物研究、入侵生物監(jiān)測(cè)預(yù)防、水生物保護(hù)(江豚、白鰭豚)、兩棲動(dòng)物監(jiān)測(cè)
一 硬件選擇
1、便攜式eDNA采樣機(jī)
型號(hào):Citizen
(便攜、操作簡(jiǎn)便、自封式濾膜*)
特點(diǎn)
無(wú)須培訓(xùn),操作簡(jiǎn)單
快速過(guò)濾大體積水樣
可使用自封濾膜*
一鍵現(xiàn)場(chǎng)過(guò)濾
適配自封式濾膜
eDNA魚(yú)類(lèi)種群采樣調(diào)查系統(tǒng)技術(shù)信息
水泵:空氣泵 攜帶方式:手提式
電壓:12V eDNA保存時(shí)間:常溫>90個(gè)自然日
電池壽命:8小時(shí) 抽濾速度:1L/min
容積:2L 電池類(lèi)型:鉛酸蓄電池
管徑:0.25英寸
專(zhuān)用自封式濾膜:0.45μm,1.2μm,5μm 材質(zhì):PES或其他
2、移動(dòng)式eDNA采樣站
(移動(dòng)式采樣站點(diǎn)、多通道平行采樣、智能化采樣)
設(shè)備特點(diǎn)
可記錄采樣點(diǎn)流速、GPS、溫度等信息
內(nèi)置計(jì)算機(jī),可導(dǎo)出采樣日志、為每個(gè)樣品標(biāo)注采樣編碼
采樣飽和后具有震動(dòng)反饋功能,可設(shè)置定量采水
具備遠(yuǎn)程藍(lán)牙遙控采水功能
可進(jìn)行多通道的同步采樣
自封濾膜(技術(shù)):采用合成樹(shù)脂材料自動(dòng)對(duì)樣本進(jìn)行脫水處理,使DNA信息能在室溫下保存90天不降解(傳統(tǒng)采樣方式需要對(duì)樣品進(jìn)行乙醇加注、冷凍、防腐等措施,費(fèi)時(shí)費(fèi)力,往往會(huì)在采樣點(diǎn)浪費(fèi)大量時(shí)間)
①降低污染——傳統(tǒng)樣品處理方式需要現(xiàn)場(chǎng)對(duì)樣品進(jìn)行防腐處理,會(huì)增加污染可能。
②提高DNA含量——與傳統(tǒng)使用乙醇相比,檢測(cè)到的DNA含量是其2倍。
③提高效率——現(xiàn)場(chǎng)無(wú)需準(zhǔn)備乙醇及緩慢的過(guò)濾工作,無(wú)需準(zhǔn)備冷凍措施低溫保存樣品,即便是沒(méi)有相關(guān)從業(yè)經(jīng)驗(yàn)的人員即可快速上手實(shí)現(xiàn)標(biāo)準(zhǔn)化的采樣工作。
技術(shù)信息:
最小流速:0.1 L/minute
最大流速:1.4 L/minute
最大采樣水樣量:999.9 L
容量精度:> 90% 0.1 L/分鐘
電池續(xù)航時(shí)間:≥8 小時(shí)
采樣點(diǎn) GPS 位置精度:2.5 米
濾膜材質(zhì):PES
過(guò)濾器材質(zhì):合成樹(shù)脂
采樣桿長(zhǎng)度:3 米(可延長(zhǎng)收攏)
遠(yuǎn)程遙控器續(xù)航:4 小時(shí)
采樣器重量:不超過(guò) 11kg
伸縮桿重量:不超過(guò) 4kg
采樣站構(gòu)成
1、智能化采樣站主機(jī) 2、多通道采樣桿 3、采樣軟管 4、eDNA過(guò)濾器—自封式濾膜* 5、鉛酸蓄電池—提供12小時(shí)續(xù)航時(shí)間 6、GPS采樣坐標(biāo)定位儀
3、背負(fù)式eDNA采樣器
型號(hào):ESBL-BACKPACK
(背負(fù)式、移動(dòng)式采樣、多通道平行采樣、智能化采樣)
設(shè)備特點(diǎn)
支持背負(fù)式移動(dòng)采樣
可記錄采樣點(diǎn)流速、GPS、溫度等信息
內(nèi)置計(jì)算機(jī),可導(dǎo)出采樣日志、為每個(gè)樣品標(biāo)注采樣編碼
采樣飽和后具有震動(dòng)反饋功能,可設(shè)置定量采水
具備遠(yuǎn)程藍(lán)牙遙控采水功能
可進(jìn)行伸縮式采樣——3米延長(zhǎng)桿
自封濾膜:采用合成樹(shù)脂材料自動(dòng)對(duì)樣本進(jìn)行脫水處理,使DNA信息能在室溫下保存90天不降解(傳統(tǒng)采樣方式需要對(duì)樣品進(jìn)行乙醇加注、冷凍、防腐等措施,費(fèi)時(shí)費(fèi)力,往往會(huì)在采樣點(diǎn)浪費(fèi)大量時(shí)間)
①降低污染——傳統(tǒng)樣品處理方式需要現(xiàn)場(chǎng)對(duì)樣品進(jìn)行防腐處理,會(huì)增加污染可能。
②提高DNA含量——與傳統(tǒng)使用乙醇相比,檢測(cè)到的DNA含量是其2倍。
③提高效率——現(xiàn)場(chǎng)無(wú)需準(zhǔn)備乙醇及緩慢的過(guò)濾工作,無(wú)需準(zhǔn)備冷凍措施低溫保存樣品,即便是沒(méi)有相關(guān)從業(yè)經(jīng)驗(yàn)的人員即可快速上手實(shí)現(xiàn)標(biāo)準(zhǔn)化的采樣工作
采樣器構(gòu)成
1. 背負(fù)式采樣機(jī)主機(jī)
2. 采樣軟管
3. 3米伸縮式采樣桿
4. 遠(yuǎn)程采水遙控器
5. 4 節(jié)5 號(hào)充電池和充電器
6. 9.6 伏鎳鎘充電池/充電器
7. Microtube 微管儲(chǔ)存箱
8. 系統(tǒng)使用快速入門(mén)簡(jiǎn)介
9. 過(guò)濾器—自封式濾膜
10. GPS采樣定位儀
二 耗材選擇
1、傳統(tǒng)濾膜過(guò)濾器
——同時(shí)兼容上述eDNA專(zhuān)用采樣器
(傳統(tǒng)濾膜)
介紹
傳統(tǒng)濾膜過(guò)濾器需要在現(xiàn)場(chǎng)采樣完后,穿戴無(wú)菌手套,用鑷子取出濾膜,加注緩沖保存液,在24小時(shí)內(nèi)低溫送至實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行后續(xù)分析。
技術(shù)信息
壓力范圍:0~0.85bar
環(huán)境操作溫度:0~40℃
兼容采樣管徑:內(nèi)徑0.25英寸
濾膜孔徑:0.45微米,1.2微米,5微米
建議濾水量:1~10L
存儲(chǔ)溫度:22℃
外殼類(lèi)型:封閉式錐形過(guò)濾殼體
2、自封式濾膜過(guò)濾器Self-preserving filter
——同時(shí)兼容上述eDNA專(zhuān)用采樣器
(DNA獲取量為普通濾膜的2倍)
介紹
自封濾膜:采用合成樹(shù)脂材料自動(dòng)對(duì)樣本進(jìn)行脫水處理,使DNA信息能在室溫下保存90天不降解(傳統(tǒng)采樣方式需要對(duì)樣品進(jìn)行乙醇加注、冷凍、防腐等措施,費(fèi)時(shí)費(fèi)力,往往會(huì)在采樣點(diǎn)浪費(fèi)大量時(shí)間)
優(yōu)點(diǎn)
①降低污染——傳統(tǒng)樣品處理方式需要現(xiàn)場(chǎng)對(duì)樣品進(jìn)行防腐處理,會(huì)增加污染可能。
②提高DNA含量——與傳統(tǒng)使用乙醇相比,檢測(cè)到的DNA含量是其2倍。
③提高效率——現(xiàn)場(chǎng)無(wú)需準(zhǔn)備乙醇及緩慢的過(guò)濾工作,無(wú)需準(zhǔn)備冷凍措施低溫保存樣品,即便是沒(méi)有相關(guān)從業(yè)經(jīng)驗(yàn)的人員即可快速上手實(shí)現(xiàn)標(biāo)準(zhǔn)化的采樣工作
自封式濾膜的使用
三 eDNA實(shí)驗(yàn)室分析
樣品(q)PCR分析并出具報(bào)告
樣品分析由上海合作實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行分析,用戶(hù)所使用的濾膜必須為廠家提供的自封式濾膜,郵寄至廠商接收點(diǎn)(常溫、無(wú)需使用乙醇等固定液),2周內(nèi)即可獲取結(jié)題報(bào)告。
自封式濾膜可參閱文獻(xiàn):
1、流程
環(huán)境DNA提取——設(shè)計(jì)合成引物接頭——PCR擴(kuò)增產(chǎn)物純化——PCR產(chǎn)物定量均一化——測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建——高通量測(cè)序——生成報(bào)告
2、樣品報(bào)告包括但不限于:
1、物種多樣性統(tǒng)計(jì)
2、物種組成分析
3、群落比較分析
4、捕撈數(shù)據(jù)一致性分析
5、... ...